atık sudaki pandemilerin izlenmesi 7 10 
Atık sudan numune almak zaman alıcı olabilir. John Eisele/Colorado Eyalet Üniversitesi

Mikrobiyologlar Susan De Uzun ve Carol Wilusz Nisan 2020'de, bir tabandan gelen atık su arıtma tesisi operatörleri grubu, Colorado kanalizasyonlarından alınan numunelerde SARS-CoV-2'yi tespit etmek için bir test geliştirmelerini ve uygulamalarını istediğinde, atık su meraklıları oldular. De Long, yararlı bakterileri inceleyen bir çevre mühendisidir. Wilusz'un uzmanlığı RNA biyolojisidir. Burada atık su gözetiminin nasıl çalıştığını ve pandemi sonrası gelecekte neler yapabileceğini anlatıyorlar.

SARS-CoV-2 için atık su nasıl izlenir?

Atık su sürveyansı, birçok insan patojeninin ve insan ilaç metabolizması ürününün idrar, dışkı veya her ikisi ile sonuçlanması gerçeğinden yararlanır. COVID-2'a neden olan SARS-CoV-19 virüsü şaşırtıcı bir şekilde ortaya çıkıyor enfekte kişilerin dışkısında büyük miktarlarda, bu hastalık bulaşmanın önemli bir yolu olmasa da.

Herhangi bir patojenin mevcut olup olmadığını anlamak için, önce ya doğrudan kanalizasyondan ya da mühendislerin "etki" dediği şeyin bir arıtma tesisine girdiği noktada temsili bir atık su numunesi toplamamız gerekir. Atık sudan çöken katıları da kullanabiliriz.

Teknisyenlerin daha sonra büyük dışkı maddesi parçacıklarını temizlemesi ve herhangi bir mikrop veya virüsü konsantre etmesi gerekir. Bir sonraki adım, patojenlerin genetik bilgisini tutan DNA veya RNA olan nükleik asitlerini çıkarmaktır.


kendi kendine abone olma grafiği


DNA veya RNA'da bulunan diziler, mevcut patojenler için benzersiz barkod görevi görür. Örneğin, SARS-CoV-2'ye özgü genleri tespit edersek, koronavirüsün örneğimizde olduğunu biliriz. Şunlara benzer PCR tabanlı yaklaşımlar kullanıyoruz klinik tanı testlerinde kullanılır, SARS-CoV-2 dizilerini tespit etmek ve ölçmek için.

Nükleik asit dizisinin daha ayrıntılı olarak karakterize edilmesi, viral suşlar hakkında bilgi sağlayabilir - örneğin, varyantları tanımlayabilir omikron BA.2 gibi.

Şu anda, atık su gözetim çabalarının büyük çoğunluğu SARS-CoV-2'ye odaklanıyor, ancak aynı teknikler, aşağıdakiler dahil olmak üzere diğer patojenlerle de çalışıyor. çocuk felci virüsü, etkilemek ve Noroviruses.

Pandemiden önce bir uygulama vardı Nadir poliovirüs salgınları için izleme çocuk felci aşısının devam ettiği bölgelerde. Atık su, çeşitli ilaçların belirtileri için de izlenebilir ve bu durum hakkında fikir verir. bir popülasyondaki uyuşturucu kullanımının düzeyi ve türü.

Veriler nereye gidiyor?

Pandemi sırasında, ABD Hastalık Kontrol ve Önleme Merkezleri, Ulusal Atıksu Gözetim Sistemi özellikle ülke genelinde SARS-CoV-2'yi izlemek için. 800'den fazla site verileri rapor ediyor Bu NWSS sistemine, ancak şu anda tüm eyaletler ve ilçeler temsil edilmemektedir.

atık sudaki pandemilerin izlenmesi2 7 10 Çeşitli büyüklükteki popülasyonları kapsayan 800'den fazla site, CDC'ye COVID-19 atık su numaralarını bildirmektedir. CDC COVID Veri İzleyici, CC BY

gibi birçok devlet kurumu Colorado Halk Sağlığı ve Çevre Departmanıve şehirler gibi Tempe, Arizona, verileri raporlamak için kendi panolarına sahiptir. Atık su analizi yapan bazı şirketler rapor verileri kendi panolarındaDe.

Bize göre, NWSS, atık su yoluyla nüfus sağlığının izlenmesinde heyecan verici bir ilk adımı temsil ediyor. Diğer ülkelerde de benzer sistemler kuruluyor, Avustralya dahil ve Yeni Zelanda.

Atık su verileri gerçekte ne gösteriyor?

Büyük popülasyonlardan gelen atık sudaki SARS-CoV-2 seviyeleri, bir topluluktaki enfeksiyon seviyesinin mükemmel bir göstergesidir. Sistem kanalizasyonda yaşayan herkesi otomatik olarak izler, bu nedenle isimsiz, tarafsız ve adildir. Daha da önemlisi, ek numuneler almadan enfeksiyonu belirli bir kişiye, haneye veya mahalleye kadar takip etmek de imkansızdır.

Atık su gözetimi, klinik testlerin mevcudiyetine veya test sonuçlarını bildiren kişilere bağlı değildir. Ayrıca asemptomatik ve semptomatik olmayan COVID-19 vakalarını da alır; bu kritik çünkü insanlar enfekte ama hasta hissetme yine de COVID-19'u yayabilir.

Bize göre, evde daha fazla COVID-19 testi yapıldığından atık su testi giderek daha önemli hale geliyor. Ve aşılamanın da yol açtığı için daha hafif ve asemptomatik COVID-19 vakaları, insanlar hiç test edilmeden enfekte olabilir. Bu faktörler, klinik vaka verilerinin pandemi öncesinde olduğundan daha az bilgilendirici olduğu ve atık su verilerinin topluluk enfeksiyon seviyesinin tutarlı bir göstergesi olmaya devam ettiği anlamına gelir. Atık su sürveyansı, pozitif bir ev testi bildiren veya hatta enfeksiyonlarının farkında olan insanlara dayanmaz. Spencer Platt/Getty Images Haberleri

Şimdiye kadar, atık sularındaki virüs seviyesine bağlı olarak bir topluluktaki enfekte olmuş bireylerin sayısını doğru bir şekilde tahmin edemezsiniz. Birinin enfeksiyon evresi, vücudunun virüse nasıl tepki verdiği, viral varyant, bir kişinin atık su örneğinin alındığı yerden ne kadar uzakta olduğu, hatta hava durumu bile her şeyi yapabilir. kanalizasyonda ölçülen SARS-CoV-2 miktarlarını etkiler.

Ancak bilim adamları, enfeksiyon oranlarında göreceli değişiklikler çıkarabilirler. Kanalizasyonda viral seviyelerin yukarı ve aşağı gidişini izlemek, bir bütün olarak toplumda vakaların yükselip yükselmediğine dair bir fikir verir.

SARS-CoV-2, atık sularda salgınlar meydana gelmeden günler hatta haftalar önce tespit edilebildiği için, atık su izleme, halk sağlığı önlemlerinin garanti altına alınabileceği konusunda erken bir uyarı sağlayabilir. Ve sinyaldeki eğilimler önemlidir – seviyelerin yükseldiğini biliyorsanız, maske zorunluluğunu yeniden uygulamak veya evden çalışmayı önermek için iyi bir zaman olabilir. Şu anda, halk sağlığı yetkilileri atık su izleme verilerini kullanıyor diğer bilgilerle birlikte test pozitifliği oranları ve bu tür kararları vermek için toplumdaki klinik vakaların ve hastaneye yatışların sayısı gibi.

Sıralamadan elde edilen veriler ayrıca yeni varyantların tespit edilmesine ve seviyelerinin izlenmesine yardımcı olabilir ve sağlık yanıtlarının mevcut varyantın özelliklerini dikkate almasına olanak tanır.

Üniversite yurtları ve bakım evleri gibi daha küçük popülasyonlarda, atık su izleme, az sayıda enfekte insanı tespit edebilir. Bu, klinik testleri hedef alan alarmı çalabilir, enfekte olmuş kişileri izolasyon için tanımlamak içindir. Erken tespit, hedefe yönelik testler ve karantinaya alma salgınları önlemede etkili. Yöneticiler, rutin izleme için klinik testleri kullanmak yerine, atık suda SARS-CoV-2'nin tespit edildiği zamanlar için yıkıcı klinik testleri rezerve edebilirler.

Gelecekte izleme nasıl olacak?

Atık su izlemenin yaygın ve rutin kullanımı, halk sağlığı görevlilerinin ABD topluluklarındaki çeşitli potansiyel enfeksiyonların seviyeleri hakkında bilgiye erişmesini sağlayacaktır. Bu veriler, enfeksiyonun arttığı yerlerde test veya aşı kliniklerinin tutulması gibi topluluklara ek kaynakların nerede sağlanacağı konusunda kararlara rehberlik edebilir. Ayrıca, maskeleme veya okulların kapatılması gibi müdahalelerin ne zaman gerekli olduğunun belirlenmesine yardımcı olabilir.

En iyi durumda, atık su izleme, yeni bir alana ilk geldiğinde yeni bir virüs yakalayabilir; çok yerelleştirilmiş bir alanda erken bir kapatma, potansiyel olarak gelecekteki bir salgını önleyebilir. İlginç bir şekilde, araştırmacılar SARS-CoV-2'yi dünyada tespit ettiler. önce toplanan arşivlenmiş atık su örnekleri herhangi birine COVID-19 teşhisi konmuştu. Atık su izleme, 2019'un sonlarında kurulan halk sağlığı altyapısının bir parçası olsaydı, SARS-CoV-2'nin küresel bir tehdit haline geldiğine dair daha erken bir uyarı verebilirdi.

Ancak şimdilik, özellikle kilit noktalarda bina seviyesinde izlemeyi içeren bir ulusal atık su gözetim sistemi kurmak ve işletmek, hala çok maliyetli ve emek yoğun.

Devam eden araştırma ve geliştirme çabaları, atık su örneklemesini basitleştirmeye ve otomatikleştirmeye çalışıyor. Analiz tarafında, yeni olanlar da dahil olmak üzere diğer patojenleri tespit etmek için PCR ve dizileme teknolojilerinin uyarlanması, böyle bir sistemden tam olarak yararlanmak için hayati önem taşıyacaktır. Sonuç olarak, atık su gözetimi, pandemilerin çok daha az ölümcül olduğu ve daha az sosyal ve ekonomik etkiye sahip olduğu bir geleceği desteklemeye yardımcı olabilir.

Yazarlar Hakkında

Susan De Uzun, İnşaat ve Çevre Mühendisliği Doçenti, Colorado Eyalet Üniversitesi ve Carol Wilusz, Mikrobiyoloji, İmmünoloji ve Patoloji Profesörü, Colorado Eyalet Üniversitesi

Bu makale şu adresten yeniden yayınlandı: Konuşma Creative Commons lisansı altında. Okumak Orijinal makale.

İlgili Kitaplar:

Beden Skoru Tutar: Travmanın İyileşmesinde Beyin Zihin ve Beden

ile Bessel van der Kolk

Bu kitap, travma ile fiziksel ve zihinsel sağlık arasındaki bağlantıları araştırıyor, iyileşme ve iyileşme için içgörüler ve stratejiler sunuyor.

Daha fazla bilgi veya sipariş için tıklayın

Nefes: Kayıp Bir Sanatın Yeni Bilimi

James Nestor tarafından

Bu kitap, nefes alma bilimini ve pratiğini araştırıyor, fiziksel ve zihinsel sağlığı iyileştirmek için içgörüler ve teknikler sunuyor.

Daha fazla bilgi veya sipariş için tıklayın

Bitki Paradoksu: Hastalığa ve Kilo Almaya Neden Olan "Sağlıklı" Besinlerdeki Gizli Tehlikeler

Steven R. Gundry tarafından

Bu kitap diyet, sağlık ve hastalık arasındaki bağlantıları araştırıyor ve genel sağlık ve sıhhati iyileştirmek için içgörüler ve stratejiler sunuyor.

Daha fazla bilgi veya sipariş için tıklayın

Bağışıklık Kodu: Gerçek Sağlık ve Radikal Yaşlanma Karşıtı için Yeni Paradigma

kaydeden Joel Greene

Bu kitap, epigenetik ilkelerinden yararlanarak ve sağlık ve yaşlanmayı optimize etmek için içgörüler ve stratejiler sunarak sağlık ve bağışıklığa yeni bir bakış açısı sunuyor.

Daha fazla bilgi veya sipariş için tıklayın

Eksiksiz Oruç Rehberi: Aralıklı, Alternatif Gün ve Uzun Süreli Oruçla Vücudunuzu İyileştirin

Jason Fung ve Jimmy Moore tarafından

Bu kitap, genel sağlık ve sıhhati iyileştirmek için içgörüler ve stratejiler sunarak oruç bilimini ve uygulamasını araştırıyor.

Daha fazla bilgi veya sipariş için tıklayın